Szkołę prowadzi Fundacja Akademia Organizacji Obywatelskich (FAOO). Jest to organizacja pozarządowa, której celem jest profesjonalizacja działań podmiotów trzeciego sektora, przyczyniająca się do skuteczniejszej i efektywniejszej realizacji ich społecznej misji.
Jej założycielem i fundatorem jest Polsko-Amerykańska Fundacja Wolności.